Analisis Keterlacakan Brucella abortus Berbasis Génom Sakabéhna anu Kahiji di Propinsi Zhejiang – Tim Bioinformatika ti Makro & Mikro-Test Nyumbang kana Publikasi Gabungan

—— Ulikan Kolaboratif ku Zhejiang CDC, Macro & Micro-Test, sareng Cina CDC Dipublikasikeun dina Frontiers in Cellular and Infection Microbiology

Tinjauan Studi

Dina Méi 2026, Frontiers in Cellular and Infection Microbiology (JCR Q1, IF ≈ 4.6) medalkeun makalah anu dipingpin ku Pusat Pengendalian sareng Pencegahan Panyakit Propinsi Zhejiang (Zhejiang CDC), sareng tim bioinformatika ti Beijing Macro & Micro-Test Bio-Tech Co., Ltd. sareng Institut Nasional Pengendalian sareng Pencegahan Panyakit Menular (China CDC) salaku ko-panulis. Panilitian ieu judulna:
"Idéntifikasi sareng analisis filogenetik tujuh galur Brucella abortus di Zhejiang, Cina."
Brucella abortus

Panilitian ieu ngawakilan analisis filogenetik sistematis anu munggaran dumasar kana sakumna génom ngeunaan Brucella abortus (B. abortus) di Propinsi Zhejiang, Cina. Tim ieu nganalisis tujuh isolat anu dikumpulkeun ti taun 2015 dugi ka 2025 (opat galur asal manusa sareng tilu galur asal sapi ti Jinhua, Quzhou, sareng Ningbo). Panemuan ieu nyayogikeun bukti génomik pikeun asal-usul sareng rute panularan "spésiés dominan kalér" ieu di daérah épidemi kidul anu teu umum di Cina wétan.

 

Latar Belakang sareng Pentingna

 

Brucellosis nyaéta panyakit zoonotik anu disababkeun ku baktéri tina genus Brucella. Brucella abortus utamina ngainféksi sapi tapi ogé tiasa nyababkeun panyakit dina manusa. Di Cina, brucellosis nunjukkeun variasi géografis anu jelas: insiden pangluhurna lumangsung di propinsi kalér (contona, Mongolia Jero, Shanxi, Heilongjiang). Sabalikna, propinsi kidul, kalebet Zhejiang, sacara historis didominasi ku Brucella melitensis, kalayan saeutik pisan kasus B. abortus anu dilaporkeun. Disparitas régional ieu ngajantenkeun karakterisasi genetik sareng pelacakan sumber B. abortus di Zhejiang janten prioritas kaséhatan masarakat anu konci.

 

Métode sareng Panemuan Kunci

Tim panalungtik ngadopsi strategi multi-cabang anu ngagabungkeun biologi molekuler sareng bioinformatika:

1.Idéntifikasi patogén sareng tipe dasar

PCR gén BCSP-31 sareng AMOS-PCR mastikeun yén sadaya tujuh isolat éta nyaéta B. abortus.

Tipe sekuen multilokus (MLST) dumasar kana salapan gén housekeeping ngungkabkeun yén sadaya isolat kagolong kana tipe sekuen ST2, nunjukkeun homogenitas genetik anu luhur di antara galur B. abortus anu sumebar di Zhejiang.
Idéntifikasi patogén sareng tipe dasar

2.Karakterisasi sakabéh génom

Sekuensing sakabéh génom dilaksanakeun dina platform Illumina NovaSeq. Analisis idéntitas nukléotida rata-rata (ANI) nunjukkeun yén isolat Zhejiang ngabagi kamiripan dugi ka 99,99% sareng galur rujukan B. abortus 544.

Analisis pan-génom ngungkabkeun populasi anu lestari pisan: 3.084 gén inti diidéntifikasi, sareng ngan ukur 10 gén cangkang, sareng teu aya gén inti lemes atanapi awan anu dideteksi.

图片1

 

3.Profil gén virulénsi sareng résistansi antimikroba

Sajumlah 68 faktor anu aya patalina jeung virulénsi diprediksi, ngawengku jalur klasik sapertos biosintésis LPS, sistem sékrési T4SS, sareng sistem pangaturan dua komponén BvrR-BvrS. Anu penting, sadaya isolat kakurangan gén adésin bmaA sareng btaF. Analisis gén résistansi ngan ukur ngadeteksi gén mprF dina database CARD, tanpa aya faktor penentu résistansi anu sanés anu diidentifikasi.

Virulénsi4. Rekonstruksi filogenetik sareng pelacakan transmisi

Analisis polimorfisme nukléotida tunggal génom inti (cgSNP) nempatkeun isolat Zhejiang dina posisi anu khusus dina tangkal filogenetik global. Hasilna nunjukkeun yén galur Zhejiang ngabentuk grup monofiletik babarengan sareng galur ti Rusia, Mongolia, sareng sababaraha propinsi Cina kalér (Ningxia, Heilongjiang, Mongolia Jero, Hebei, Gansu, Beijing). Grup ieu salajengna dibagi kana tilu subclade anu béda (Clade 1–3), nunjukkeun sababaraha kajadian bubuka mandiri.

Rekonstruksi filogenetik

Kacindekan sareng Implikasi

 

Panilitian ieu nyayogikeun sét data génomik presisi tinggi munggaran ngeunaan B. abortus di Propinsi Zhejiang sareng ngahasilkeun sababaraha kacindekan konci:

 

  1. Clear latar tukang genetik– Galur B. abortus anu sumebar di Zhejiang kagolong kana ST2, sacara génomikna lestari pisan, sareng ngawakilan garis keturunan brucellosis sapi anu has.

 

2. Evidénsitas transmisi lintas régional– Analisis filogenetik henteu ngadukung ayana garis keturunan endemik mandiri di Zhejiang. Sabalikna, data nunjukkeun sacara kuat yén galur ieu asalna ti Cina kalér sareng tiasa ngabagi latar évolusi anu sami sareng galur ti Rusia sareng Mongolia. Ayana tilu subklade nunjukkeun sababaraha kajadian bubuka anu misah.

 

3. Implikasi kaséhatan masarakat– Panemuan ieu nunjukkeun pentingna panjagaan génomik pikeun brucellosis bahkan di daérah anu sacara tradisional henteu endemik sapertos Zhejiang. Sanaos jumlah kasus ayeuna rendah, alat-alat résolusi tinggi sapertos cgSNP tiasa sacara efektif ngalacak sumber wabah impor sareng nyayogikeun bukti ilmiah pikeun ngaganggu ranté transmisi anu aya hubunganana sareng transportasi ingon-ingon antar propinsi.

 

Ieu panalungtikan teu ngan ukur ngeusian lolongkrang panalungtikan di Propinsi Zhejiang tapi ogé nyayogikeun data dasar anyar pikeun panjagaan patogén sareng penilaian résiko brucellosis di daérah Delta Walungan Yangtze.

 

Inpormasi Kertas:
Yang, Y., Shi, X., Chen, J., Wang, L., Wu, Z., Yao, W., … & Wu, B. (2026). Idéntifikasi sareng analisis filogenetik tujuh galur Brucella abortus di Zhejiang, Cina. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 16, 1758965.

 

 


Waktos posting: 10-Jun-2026